主要为害叶片，也可为害果实、叶柄、果柄、新梢。发病后的主要症状特点是：病部橙黄色，组织肥厚肿胀，表面初生黄色小点（性子器），后渐变为黑色，后期病斑上产生黄色的长毛状物（锈子器）。
彻底砍除果园周围5km内的桧柏，中断锈病的侵染循环，对于不能砍除桧柏的地区，应对桧柏进行喷药保护，在苹果萌芽前消除桧柏上的越冬菌瘿，可喷洒硫酸铜钙、或戊唑·多菌灵、或甲硫·戊唑醇、或石硫合剂，杀灭越冬病菌。
(2)(1)喷药保护苹果：往年锈病发生较重的果园，在苹果展叶至开花前、落花后及落花后半月左右各喷药一次，即可有效控制锈病的发生，常用药剂有70％甲基硫菌灵可湿性粉剂800倍液、或25％戊唑醇可湿性粉剂2000倍液，或5％己唑醇水乳剂1500倍液，或12.5％烯唑醇可湿性粉剂2000倍液。隔10～15天喷1次，连续2～3次等
病原以菌丝体在桧柏、龙柏上的菌瘿中越冬，翌春形成褐色的冬孢子角，冬孢子柄被有胶质，遇降雨或空气极潮湿时胶化膨大，冬孢子萌发产生大量担孢子，随风传播到苹果树上，侵染苹果树叶片、果实、新梢等，形成性孢子器和性孢子、锈孢子器和锈孢子。锈子成熟后，随风传播到相上，侵害桧柏枝条，以菌丝体在桧柏病部越冬。菌原没有夏孢子，每年仅侵染1次，属单病程病害。春天果树幼嫩组织开始长出到开花前后。如果天气较温暖，气温在17-20℃、阴雨连绵，连续两天降雨达50mm以上有利于病菌产生、传播和侵染，则锈病发生严重。相反，这段时间若天气干旱、雨水稀少，则锈病发生轻或很少发生。
