病原不同，主要危害部位和时期也不同。穗轴褐枯病主要危害花穗、果穗及幼果，所以应注意开花前和落花后防治该病，可用克菌丹、多菌灵、百菌清、甲基硫菌灵等防治；而褐斑病主要危害叶片，发病初期可以使用代森锰锌、波尔多液、多菌灵等。
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