小麦黑潜叶蝇主要在小麦越冬前和小麦返青后两个时期为害小麦的叶片。成虫多产卵于麦苗第1～4片叶或返青后小麦叶片的尖端部，少数产于叶缘和叶基。小麦叶片被小麦黑斑潜叶蝇成虫产卵器为害后，叶片上半部留下一行行较均匀类似于条锈病的淡褐色针孔状斑点，以后逐渐呈黄色小斑点状。卵孵化后，幼虫在麦苗叶片内上下表皮之间为害，潜食叶肉，仅剩透明的上下表皮，虫道较宽，潜痕呈袋状，内有黑色虫粪。被害叶片从叶尖到叶中部，枯黄或呈水渍状，严重的造成小麦叶片前半段干枯，严重影响光合作用和正常生长
每亩用48％毒死蜱乳油或5％高效氯氟氰菊酯乳油50ml对水30～45kg喷雾，或用1％阿维菌素1000~1500倍液喷雾，可同时兼治小麦蚜虫、红蜘蛛。
成虫体长2mm，黄褐色。头部黄色，间额褐色，单眼三角区黑色，复眼黑褐色，具蓝色荧光。触角黄色，触角芒不具毛。胸部黄色，背面具一'凸'字形黑斑块，前方与颈部相连，后方至中胸后盾片中部，黑斑中央具'v'字形浅洼;小盾片黄色，后盾片黑褐色。翅透明浅黑褐色。平衡棍浅黄色。各足腿节黄色。腹部5节，背板侧缘、后缘黄色，中部灰褐色生黑色毛;产卵器圆筒形黑色。幼虫体长2.5-3.0mm，乳白色，蛆状，前气门1对，黑色;后气门1对黑褐色，各具1短柄，分开向后突出。 腹部端节下方具1对肉质突起，腹部各节间散布细密的微刺。蛹长2mm，浅褐色，体扁，前后气门可见。
成虫白天在麦株上部活动。尤喜在长势旺、偏施氮肥麦田活动、产卵。卵多产于近叶尖处，少数产于叶缘和叶基。初孵幼虫即钻入叶片，潜食叶肉，形成隧道。初时食量少，隧道呈细线状，幼虫取食时左右摇摆躯体，用口器凿进。2-3龄后食量增加，隧道加宽，内积灰黑色虫粪。一般1片叶仅有1头幼虫，少有2～3头。麦田周围受害比田中重。老熟幼虫突破叶片上表皮，有的爬行至叶缘，有的在原处。大多数个体躯体前端向腹部弯曲，弹跳落地，亦有一些个体前端朝下，直接坠地。一般晚间坠地者较白天多。坠地入土后当天即化蛹，以蛹越冬。翌年3~4月羽化
